Trung tâm Y tế huyện Cầu Kè chính thức đi vào hoạt động kể từ ngày 01 tháng 07 năm 2017 với tổng số viên chức hoạt động chuyên môn là 148 người tại tuyến huyện và 73 người ở tuyến xã. Hiện tại, Trung tâm Y tế huyện Cầu Kè có tổng số 15 khoa/phòng (Số khoa lâm sàng: 04; Số khoa cận lâm sàng: 04; Số khoa dự phòng: 03; Số phòng: 04) và 11 Trạm Y tế xã, thị trấn trực thuộc